一、 FAT32文件系統

　　FAT32使用4個字節(也就是32位)的空間來表示每個扇區(Sector)配置文件的情形，故稱之為FAT32。FAT16的分區容量上限是2047MB，而FAT32的分區容量下限是512MB，不同操作系統的上限不同，例如Win2000最大支持32GB FAT32分區，而WinXP最大可達2TB FAT32分區。

　　1、FAT32相比FAT16，優點如下：

　　可支持大于2GB的分區。最大可達2TB，即便是目前最大容量的硬盤都能支持，更別說U盤了; 空間利用率更高。FAT32采用了更小的簇，可以更有效率的保存數據，比如兩個分區大小都為2GB，一個分區采用了FAT16文件系統，另一個分區采用了FAT32文件系統。采用FAT16的分區的簇大小為32KB，而FAT32分區的簇只有4KB的大小。這樣在存儲碎文件時FAT32就比FAT16的存儲效率要高很多，通常情況下可以提高15%。 安全新更好。FAT32文件系統可以重新定位根目錄和使用備份副本。另外FAT32分區的啟動記錄被包含在一個含有關鍵數據的結構中，減少了計算機系統崩潰的可能性。 靈活性更高。FAT32分區上的根文件夾是普通的簇鏈，因此它可以位于驅動器上的任何位置。以前對根文件夾數量的限制不復存在。此外，可以禁用文件分配表鏡像，這樣就可以讓文件分配表的副本而不是讓第一個文件分配表處于活動狀態。這些功能允許您動態重調FAT32分區的大小。不過要注意，雖然FAT32的設計允許這一功能，但微軟自己的分區軟件不支持此功能，需要使用第三方分區軟件。

　　2、使用FAT32格式化2GB U盤，簇更小

　　3、FAT32的缺點

　　雖然對于最大分區容量的支持上面，FAT32 2TB最大分區的容量時至今日仍不過時，但FAT32只能存儲最大4GB的單個文件，所以FAT32無法存放光盤ISO鏡像、高清視頻、各種圖形作品文件等等，這是其致命的弊端。

　　二、NTFS文件系統

　　NTFS(New Technology File System)是Windows NT核心和高級服務器網絡操作系統環境的文件系統。NTFS的目標是提供比FAT32更高的可靠性，并消除FAT文件系統中的種種限制。

　　NTFS文件系統除了支持更大的分區、更大的文件、更節約硬盤空間外，還提供了FAT文件系統不敢想像的眾多功能。主要有：長文件名、壓縮分區、事件追蹤、文件索引、高容錯性、數據保護和恢復、加密訪問……

　　1、NTFS支持大于4GB的文件

　　由于NTFS分區已經成為目前電腦磁盤的絕對主流格式，XP、Vista、Win7默認都會將分區格式化為NTFS系統，因此關于NTFS的種種優勢和特性就沒必要多做強調了，可以說NTFS是目前最好的磁盤文件系統，但為什么U盤和各種存儲卡很少使用NTFS文件系統呢?

　　2、 NTFS在閃存上的缺陷

　　NTFS雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬盤而設計的，對于新興的Flash閃存材料不一定適用。NTFS分區是采用“日志式”的文件系統，因為要記錄磁盤的詳細讀寫操作，對U盤這種快閃存儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個文件或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的U盤比較容易損壞，而且400MB以下的分區也比FAT16更浪費空間。

　　NTFS這些額外的功能無論對SSD硬盤和U盤都會造成不同程度的傷害，因此新一代Windows 7操作系統專門針對SSD進行優化，通過各種手段減少讀寫次數和碎片的產生。而對于神州U盤來說，本身USB的帶寬就有限，NTFS文件系統頻繁讀寫占據通道會讓磁盤性能降低，為此微軟專門針對移動存儲設備開發了ExFAT文件系統。