PE系統提供了三種方法啟動自定義腳本：Winpeshl.ini、Startnet.cmd 和 Unattend.xml。原生態WinPE系統的默認界面是“命令提示符”窗口，但可以創建自定義的Winpeshl.ini文件，以便運行自己的外殼應用程序。也可以創建自己的 Startnet.cmd批處理文件來運行特定的命令集、批處理文件或腳本。Unattend.xml是WinPE 2.0的新應答文件格式，它取代了Winbom.ini和Winpeoem.sif。

　　一、使用Winpeshl.ini添加自定義腳本：

　　可以使用Winpeshl.ini的文件來啟動自定義的外殼應用程序。Winpeshl.exe將在啟動期間處理Winpeshl.ini中的設置。使用文本編輯器(如記事本)創建具有以下文件目錄結構的Winpeshl.ini文本文件。例如：

　　[LaunchApp]

　　AppPath = %SYSTEMDRIVE%myshell.exe

　　[LaunchApps]

　　%SYSTEMDRIVE%mydirapplication1.exe， -option1 -option2

　　application2.exe， -option1 -option2

　　注：將AppPath項設置為外殼應用程序的路徑。此路徑可以是絕對路徑，也可以使用環境變量(相對路徑)，例如%SYSTEMROOT%System32Myshell.exe。AppPath 項不支持命令行選項。將此文件保存到WinPE系統映像的%SYSTEMROOT%System32下。

　　二、使用Startnet.cmd添加自定義腳本：

　　使用Startnet.cmd可以在WinPE系統中添加自定義的命令行腳本。默認情況下，WinPE系統包括Startnet.cmd腳本，此腳本位于WinPE系統映像的 %SYSTEMROOT%System32 中。當前，主要用Startnet.cmd來啟動Wpeinit.exe。用于安裝即插即用 (PnP) 設備、處理 Unattend.xml 設置以及加載網絡資源。編輯Startnet.cmd 以包括自定義命令。

　　注意：對于PnP和網絡支持，請確保在自定義Startnet.cmd腳本中包含了對wpeinit的調用。

　　三、使用Unattend.xml添加自定義腳本：

　　運行imagex /info d：boot.wim，查看WinPE系統映像的信息。我們要注意這一行：

　　Image Count： 2

　　說明此WinPE系統映像文件中其實包含了兩個映像。每個映像的詳細信息在后面有詳細的說明。這里要特別說明的是我們需要編輯的是第二個名稱為WDS的映像，因為WDS使用此映像來引導計算機。

　　使用imagex命令加參數mountrw將 *.wim 加載到pemount目錄中：

　　imagex /mountrw c：winpe2pe2.wim 2 c：pemount

　　使用peimg命令將第三方驅動添加到WinPE 2.0系統中，如需添加多個設備驅動請重復該步驟。

　　peimg /inf=c：winpe2netdrvxxx.inf c：pemountwindows

　　使用imagex命令加參數unmount及commit將修改寫入到 *.wim 中。

　　imagex /unmount c：pemount /commit