修改MySQL下的默認mysql數據庫的user表，刪除所有host為localhost記錄，另外添加一些其他記錄，重新啟動MySQL服務器。執行show databases，只出現information_schema和test兩個數據庫，看不到mysql。

解決方法：

此問題實際上是用戶沒有權限：

1. 關閉mysql

2. 啟動mysql： mysqld_safe --skip-grant-tables

在數據庫名mysql下的user表中，修改相應權限，比如：

INSERT INTO `user` VALUES ('localhost','root','','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','Y','','','','',0,0,0,0);