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Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法

2020-02-16 00:51:50
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供稿:網(wǎng)友

mhd格式的文件里面包含的是raw圖像的一些頭信息,比如圖片大小,拍攝日期等等,那么如何可視化圖像呢?

import cv2import SimpleITK as sitkimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npimage =sitk.ReadImage(path)image = sitk.GetArrayFromImage(image)#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integerplt.imshow(image,cmap='gray')plt.axis('off')plt.show()cv2.imwrite('1.png',image)

這里path是mhd文件的路徑,并且在該路徑下需要有相應(yīng)的raw文件

這里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存

在這里如果cv2和ITK模塊沒有的話可以用pip安裝

pip install opencv-python pip install SimpleITK

以上這篇Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持武林站長站。

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