安裝JDK后，java目錄下有jdk和jre兩個目錄，但jdk下還有一個jre目錄，而且這個jre比前面那個jre在bin目錄下少了個server文件夾（Server端的Java虛擬機）！前一個jre俗稱通用jre，后一個俗稱內置jre。如下圖所示：

兩個jre大體相同，有細微的差別。

JDK里面有很多用Java所編寫的開發工具（如javac.exe、jar.exe等），而且都放置在 /lib/tools.jar 里面，它們本身運行的時候必須自行附一套JRE才行；所以開發人員需要 java 開發環境，安裝jdk時，內置jre在JDK安裝過程中會自動安裝。

通用JRE則是用來執行我們自己編寫的JAVA程序；所以普通用戶裝通用jre即可。

注意：因為編譯時，系統找的是jdk下的jre，而不是最外層的jre。這意味著外層jre不能用于調試，否則會報錯，例如在eclipse中會提示Unknown Source

再說三個lib

JDK下的lib包括java開發環境的jar包，是給JDK用的，例如JDK下有一些工具，可能要用該目錄中的文件。例如，編譯器等。JRE下的lib只是運行java程序的jar包，是為JVM運行時候用的。包括所有的標準類庫，和擴展類。JDK下的JRE下的lib是開發環境中，運行時需要的jar包。最典型的就是導入的外部驅動jar包。因為編譯時，系統找的是jdk下的jre。而不是最外層的jre。

最后我在這里補充幾點: 1. 在使用Eclipse的時候不需要指定的CLASSPATH,Eclipse會自己搜索. 2. 獨立目錄下的jre是通用jre,安裝時是可選的（選擇了，則會覆蓋已有版本）。jdk目錄下的jre則是必須的。如果你在eclipse里指定jdk的路徑（jre的路徑不用你指定，會自己去找的，用的就是這個內置jre。而java, web, start等，用的則是通用jre。

更詳細深入分析請參考文章：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9ba71d0b01014bux.html